目前学院下设4个系（软件工程系、数字媒体技术系、信息安全技术系、软件服务工程系(与IBM共建），1个中心（北京理工大学软件评测中心），另建有2个北京市重点实验室（数字表演与仿真技术实验室、软件安全技术实验室），1个北京市实验教学示范中心（数字媒体技术实验教学中心），1个国防科技工程中心（网络信息安全工程中心）。2011年8月，软件工程学科获一级学科博士点授权，从2012年起可在四个二级学科下招收博士研究生。软件学院已培养软件工程硕士2000余人，就业于国内外软件企业、国防工业和信息服务行业、政府及金融行业等，得到了用人单位的好评。
学院按照“创新型、复合型、实用型、国际化人才”的培养目标，针对目前软件行业对人才的需求，设有软件工程、数字媒体技术、信息安全技术三个专业方向，2007年被列为教育部质量工程立项建设的特色专业；在硕士研究生的培养上，突出多学科方向的交叉与融合，根据行业需求及时调整设立多个培养方案的人才培养模式，为软件服务业、信息服务业等输送高层次软件人才。
学院注重新型交叉学科的建设，积极探索研究软件与其他学科结合中的问题，加强应用研究，不断丰富完善多学科融合的学科体系，服务于“两化融合”和国内外包括文艺演出、数字电影、数字节目在内的文化创意产业。2007年获得批准建设北京市重点交叉学科“数字表演与仿真技术”。
学院注重学生的思想政治教育，注重学生创新精神、实践能力和综合素质的培养，于2008年建立了学生创新实践基地，并于2011年成为面向全校开放的“北京理工大学软件科技大学生创新创业基地”。2008年以来，基地共获得省部级以上科技竞赛奖励631人次，其中国际级92人次、国家级462人次、省部级77人次。如第十一届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛一等奖、第十四、十五届国际博弈锦标赛六子棋项目金奖、“中科杯”全国软件设计大赛特等奖（连续两届）、全国大学生数学建模竞赛一等奖、全美大学生数学建模竞赛一等奖、中国机器人大赛暨RoboCup公开赛一等奖、中国机器人大赛创意设计大赛特等奖、全国大学生信息安全竞赛一等奖（连续四届）、ACM/ICPC国际大学生程序设计竞赛亚洲区选拔赛金奖、IBM-Jazz全国创新大赛一等奖、第五届“挑战杯”首都大学生课外学生科技作品竞赛特等奖、第七届首都“挑战杯”创业设计大赛金奖等。2010年7月，光明日报、中国教育电视台等17家媒体对基地工作进行了详实地报道和宣传，产生了积极的社会影响和效果。这些学生自主参与的创新实践活动，为培养学生的创新能力和科研精神起到了极大的推动作用。
学院在培养人才的同时，积极承担科研开发工作，近几年学院近百名的师生团队，全面参与承担了北京奥运会开闭幕式、国庆60周年、上海世博会、广州亚运会等大型活动的安保及庆典仿真项目，为这些活动的成功举行做出了重大贡献，为学校及学院赢得了良好的声誉。
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